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RNA酶無處不在，在實驗操作的任何一步，任何偶然的疏忽或不妥當的操作都有可能造成RNA酶的污染，從而導致整個實驗的失敗。因此，嚴格控制實驗條件，避免任何可能的污染，是保證實驗成功的關鍵。為此，必須作到以下幾點：

1.如果可能，實驗室應專門辟出RNA操作區，盧湘儀低溫離心機，移液器，試劑等均應專用。RNA操作區應保持清潔，并定期行除菌。

2.如果可能，在超凈臺中按照細胞培養的要求進行操作，可以有效避免操作中引起的RNA酶污染。

3.操作過程中應始終戴一次性橡膠手套，并經常更換，以防止手、臂上的細菌和真菌以及人體自身分泌的RNA酶帶到試管或污染用具，盡避免使用一次性塑料手套。塑料手套不但常常造成操作不便，且塑料手套的多出部分常常在器具的RNase污染處和RNase-free處傳遞RNase，擴大污染。

4.避免在操作中說話聊天。也可以戴口罩以防止引起RNA酶污染。

5.盡量使用一次性的塑料制品，盡量避免共用器具如濾紙，tips，tubes等，以防交叉污染。例如，從事RNA探針工作的研究者經常使用RNase H，T1等，在操作過程中極有可能造成移液器、離心機等的污染。而這些污染了的器具是RNA操作的大敵。

6. 關于一次性塑料制品，建議使用廠家供應的出廠前已經滅菌的tips和tubes等。多數廠家供應的無菌塑料制品很少有RNA酶污染，買來后可直接用于RNA操作。許多研究者用DEPC等處理的塑料制品，往往由于二次污染而帶有RNA酶，從而導致實驗失敗。

7.配制溶液用的酒精、異丙醇、Tris等應采用未開封的新瓶。

8.所有舊塑料制品都必須用0.5M的NaOH處理10分鐘，用雙蒸水徹底沖洗，DEPC-H20浸泡過夜后滅菌。

9.無法用DEPC處理的用具可用氯仿擦拭若干次，這樣通常可以消除RNA酶的活性。但氯仿會溶解某些塑料制品，應當注意。

10.RNase AwayTM試劑可以替代DEPC，操作簡單，價格低，且無毒性。只需將RNase AwayTM直接倒在玻璃器皿和塑料器皿的表面，浸泡后用水沖洗去除，即可以快速去除器皿表面的RNase，并且不會殘留而干擾后繼實驗。

11.如果您需要遠距離運輸或長期儲藏RNA樣品，建議先將標本（細胞、組織）保存在RNA保存液（RNAwait、RNAlater）中，使細胞內的RNA與RNA酶分離，在室溫可以保存7天，4℃可以保存4周，-20℃、-80℃可以長期存檔保存標本，RNA質量不受影響，用各類方法抽提仍可以獲得高質量的RNA。